Ses fleurs brun-pourpre très sombre, presque noires, sont uniques parmi les géraniums vivaces de jardin. Avant la floraison, les feuilles largement découpées en lobes dentés se ressemblent beaucoup entre les deux espèces, en sous-bois comme au jardin. La fleur tranche aussitôt : brun-pourpre foncé à pétales réfléchis vers l'arrière chez le géranium brun, contre bleu-violet à cœur blanc chez le géranium des bois.