Le pommier sauvage a des fruits plus petits et acides, et souvent des rameaux épineux — le pommier cultivé n'en a pas.
Le pommier pourpre garde un feuillage pourpre à son débourrement mais vire au bronze-vert en cours de saison, ce qui peut le rapprocher visuellement du pommier sauvage. On les distingue par la couleur des fleurs (blanc rosé pâle chez le pommier sauvage, contre rose-pourpre vif chez le pommier pourpre) et par les petits fruits : amers/acides et tombant chez le pommier sauvage, décoratifs et persistants tout l'hiver chez le pommier pourpre.
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